然而，學術查重并非是能鑒別全部的參考文獻，唯有有一些吻合格式的參考文獻才會學術鑒別，這也就意味著唯有當參考文獻格式標準且正確的階段，學術才能將該部分參考文獻排出在查重范疇之外。
因此，可確定的說，學術查重不包括格式正確的參考文獻。還有一種事由就可能是你使用的學術查重系統(tǒng)并非是正規(guī)的學術查重，因為這種官方網站并非是正規(guī)的學術查重系統(tǒng)，因此就引發(fā)無法鑒別出參考文獻部分，從而引發(fā)畢業(yè)論文中的參考文獻被標紅。綜上，學術查重并不包括參考文獻，學術查重一般來說只針對畢業(yè)論文的提要部分、英文提要部分、正文部分及附錄部分來查重，而參考文獻并不在學術查重范疇之內。
因此，畢業(yè)論文撰寫者不用緊張因要羅列非常多的參考文獻在畢業(yè)論文當中。
但，唯有正規(guī)的學術才會鑒別參考文獻，另外其還有一個前置性條件是參考文獻格式正確，這也意味著畢業(yè)論文撰寫者絕對到學術不端網的“學術查重入口”等正規(guī)的學術查重網站來查重，且要依據(jù)規(guī)定寫參考文獻，保障學術能鑒別。
